辦理三類醫療器械許可證的流程如下：

1. 準備申請材料：包括公司營業執照副本、法人身份證復印件、法人委托書、經辦人的身份證和戶口本復印件；經營場所的產權證明或者租賃合同；與醫療器械經營有關的主要管理人員、質量負責人和質量控制負責人名單；對從事醫療器械經營的專職負責人，應具有大專以上學歷并具有3年以上相關工作經歷并取得相應資質；有必要的技術開發（含經營范圍中增加“醫療器械經營”或產品說明中增加“醫療設備”）等。2. 提交申請：向所在地的省級藥品監督管理部門（如省、自治區、直轄市人民政府藥品監督管理部門）提交書面申請和所需材料。3. 受理與審查：藥品監督管理部門會對申請材料進行受理和審查，檢查材料是否齊全、是否符合法定形式，并會進行必要的現場核查。4. 審批與發證：如果申請材料經審查合格，藥品監督管理部門會進行審批，并在一定時間內（通常為5個工作日）頒發《醫療器械經營許可證》。5. 備案產品網上注冊：如果涉及備案產品，還需要在相關網站上進行網上注冊備案。請注意，具體的辦理流程可能因地區和政策的不同而有所差異。在辦理過程中，建議與所在地的藥品監督管理部門保持密切溝通，確保按照Zui新規定和要求進行申請。同時，務必確保所提交的材料真實、準確、完整，以避免影響審批進度和結果。